2004年，蔡榮裕、楊明敏和劉佳昌三人組成籌備小組 (Task Force for Facilitating the Taiwan Center for the Development of Psychoanalysis)，開始向國際精神分析學會 (I.P.A., International Psychoanalytic Association) 申請成為它的一個聯盟機構 (Allied Center)。同年3月，於紐奧良的國際精神分析世界會議，向當時的會長Daniel Widlöcher教授正式提出申請。
2004年11月，臺灣精神分析學會成立，蔡榮裕為創會理事長。
2005年起，學會固定在週三晚間舉辦精神分析的入門課程，後續分別在台中和高雄等地展開，持續至今。
2005年韓國精神分析師Dr. Do-Un Jeong，和國際精神分析學會當中國際新團體(I.N.G.)負責人Dr. David Sachs分別前後來台評估。同年年底，國際精神分析學會的理事會通過，臺灣精神分析學會於2006年起成為國際精神分析學會的聯盟組織。
2007年5月，國際精神分析學會指派Dr. Michael Gundle和Dr. Erik Gann組成評估小組 (Review Committee)，第一次來訪。訪問評估結束之際，理事長蔡榮裕綜合大家的意見，傳遞給國際友人，期望他們能夠更了解和尊重我們學會的獨特性──即其複雜性和異質性。我們的意見有兩層意義。一是尊重成員不同的精神分析訓練背景，讓源自不同國家或學派的精神分析共存共榮，以期待一種最適合台灣的精神分析形態漸漸發展成形。另一層意義是，我們尊重每個會員在精神分析之路上各自的步伐，學會願意幫助所有會員就其個別專業成長狀態，各取所需。
2008年10月，評估小組第二次來台，兩次的評估報告對於我們有高度的肯定。
2009年，劉佳昌接任理事長。學會組成籌備小組 (Task Force for Study Group)，以推動學會申請成為國際精神分析學會當中的研究團體 (Study Group)。12月，周仁宇自西雅圖分析學會 (Seattle Psychoanalytic Society and Institute) 完成學習，成為美國精神分析學會(APsaA)和國際精神分析學會體系認證合格的精神分析師，成為本會第一位國際精神分析學會的分析師。
2010年10月，積極參與國際精神分析學會在北京舉行的首屆亞洲精神分析大會(The 1st Asian Psychoanalysis Conference of IPA )，有超過十三位會員與會，發表多篇論文。理事長劉佳昌代表學會出席大會開幕式及閉幕式，並在閉幕式受邀發表與會感言。劉佳昌也代表學會發表論文”Formosa Model: An Emerging Tradition of Developing Psychoanalysis in Taiwan”。
2011年6月，正式向國際精神分析學會提出申請成為研究團體。
2013年，周仁宇接任理事長。7月底在捷克布拉格(Prague)舉行的第48屆國際精神分析世界會議 (IPA Congress)，多位會員出席。劉佳昌出席其中的研討會提出報告，研討會的主題為"The World is Looking East. Growth and Development of Psychoanalysis in the Asian Region"。
